Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms