Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabrg1Q9R0Y8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms