Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek3Q9R0A5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms