Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AmfrQ9R049 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AmfrQ9R049 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms