Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms