Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps29Q9QZ88 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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