Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ29

Igbp1b, Immunoglobulin-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1bQ9QZ29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igbp1bQ9QZ29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Igbp1bQ9QZ29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms