Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxe3Q9QY14 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms