Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms