Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms