Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pcsk1nQ9QXV0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pcsk1nQ9QXV0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms