Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChmQ9QXG2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChmQ9QXG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms