Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limd1Q9QXD8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms