Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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