Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyhr1Q9QXA1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyhr1Q9QXA1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms