Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms