Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms