Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Txnrd1Q9JMH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Txnrd1Q9JMH6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms