Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2bQ9JME9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm2bQ9JME9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms