Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prg4Q9JM99 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prg4Q9JM99 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms