Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LitafQ9JLJ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LitafQ9JLJ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms