Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col5a3Q9JLI2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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