Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin3Q9JLB9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms