Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms