Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnga3Q9JJZ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms