Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Alyref2Q9JJW6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms