Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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