Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Bco1Q9JJS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bco1Q9JJS6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Bco1Q9JJS6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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