Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms