Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmbr1Q9JIT0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms