Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnmb4Q9JIN6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms