Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RabggtaQ9JHK4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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