Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tnfrsf13bQ9ET35 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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