Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tm9sf3Q9ET30 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf3Q9ET30 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms