Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms