Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ush1cQ9ES64 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms