Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc4Q9ES56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms