Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chrnb2Q9ERK7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrnb2Q9ERK7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms