Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slco1c1Q9ERB5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms