Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clstn2Q9ER65 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clstn2Q9ER65 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms