Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms