Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms