Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr6Q9EQ16 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcr6Q9EQ16 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms