Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r56Q9EPS9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r56Q9EPS9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms