Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms