Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pak1ip1Q9DCE5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pak1ip1Q9DCE5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms