Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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