Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms