Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syde1Q9DBZ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde1Q9DBZ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms