Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms